Thèse de doctorat en écologie marine (F/H/X)

Les missions attendues sont :

• S’imprégner de la littérature actuelle dans le domaine de l’analyse d’images sous-marines et proposer et tester des protocoles d’annotation d’images sous-marines optimisés sur la base d’une banque d’images sous-marines déjà acquise mise à disposition par des partenaires du projet ;
• Extraire les données biologiques de ces banques d’images sous-marines afin d’étudier et analyser les patterns de biocolonisation sur de larges échelles spatio-temporelles (par ex pour identifier ses spécificités sur différentes provinces biogéographiques) ;
• Organiser, préparer et participer à des campagnes de terrain en mer afin de déployer différentes méthodes de suivi de la biocolonisation sur deux sites d’étude : la structure de protection du câble d’export d’un parc éolien en mer en Atlantique ainsi que le mât de mesure du parc éolien de Fécamp en Normandie ;
• Dépouiller les échantillons obtenus lors des différentes campagnes de terrain e.g. détermination de la macrofaune benthique, analyse d’images, préparation d’échantillons pour séquençage de l’ADN ;
• Analyser statistiquement et comparer les données de biodiversité obtenues avec les différentes méthodes de suivis ;
• Organiser, préparer et participer à des campagnes de terrain en mer biannuelle pour étudier la biocolonisation de structures artificielles éco-conçues et non-éco-conçues déployées in-situ ;
• Mesurer des flux d’oxygène et de carbone (CO₂ et carbone organique) afin de caractériser le métabolisme des communautés associées à des structures artificielles éco-conçues ;
• Analyser et interpréter statistiquement les patterns de succession écologique de la biocolonisation ;
• Restituer les résultats obtenus à des conférences internationales et les valoriser sous-forme d’articles scientifiques.

Le travail de thèse s’effectuera entre France Energies Marines, IFREMER et l’Université de Caen